Фамилия Бергунова — женская форма фамилии Бергунов. Её происхождение связано с прозвищем или мирским именем «Бергун». Слово «бергун» в русских говорах имело несколько значений, и установить единственную основу сложно, но самая вероятная версия — профессиональная.

В большинстве случаев «бергун» означало «бергмейстер» или «горный мастер» — специалиста по горному делу, рудознатца. Слово пришло из немецкого Bergmann (горняк) через профессиональную лексику уральских и сибирских заводов. Прозвище Бергун могли дать человеку, который работал на руднике, плавильне или занимался поиском руд. Фамилия образована по типичной русской модели: к основе на твёрдый согласный добавили суффикс -ов, получилась форма Бергунов, а от неё — Бергунова.

Есть и другая, менее распространённая версия. В некоторых диалектах «бергун» называли ворчливого, брюзгливого человека, того, кто постоянно «бергунит» — ворчит, недоволен. В этом случае фамилия отражала не профессию, а особенность характера.

Суффикс -ов(-а) указывает на то, что фамилия сформировалась в центральных и северных регионах России, где эта модель была основной для крестьянских и мещанских родов. На Урале и в Сибири, где горное дело было распространено, фамилия Бергунов могла закрепиться за целыми династиями потомственных горняков.

Фамилия редкая. Встречается преимущественно на Урале, в Пермском крае, Свердловской области и в Сибири — там, где в XVIII–XIX веках активно развивалась горнодобывающая промышленность. Если ваши предки Бергуновы родом из этих мест, с высокой вероятностью они были связаны с рудниками или заводами.