Фамилия Беркинбаев — типичный пример тюркской фамилии, образованной по русской модели с помощью патронимического суффикса -ев. Её основа — составное мужское имя Беркинбай, распространённое у казахов, киргизов, узбеков и других тюркских народов. Первая часть, «беркин», восходит к тюркскому слову со значением «крепкий», «прочный», «надёжный» (иногда также «упрямый»). Вторая часть, «бай», означает «богач», «хозяин», «господин». В дореволюционной кочевой среде «бай» было не столько указанием на реальное богатство, сколько пожеланием благополучия и статуса.

Таким образом, имя Беркинбай буквально означает «крепкий (надёжный) богач» или «прочный господин». Имя давали с надеждой, что мальчик вырастет физически сильным, состоятельным и твёрдым в решениях. Фамилия Беркинбаев, следовательно, означает «потомок Беркинбая». Русский суффикс -ев здесь присоединяется к основе, заканчивающейся на гласный, что стандартно для адаптации тюркских имён в русской антропонимике (ср. Ахметбаев, Тулебаев).

В отличие от многих русских фамилий, которые могли происходить от прозвищ по ремеслу или внешности, Беркинбаев — фамилия «патронимическая» в чистом виде: она прямо указывает на имя отца или деда. В казахской и киргизской среде такие фамилии массово закреплялись в советское время, в 1930–1940-е годы, когда проводилась паспортизация и требовалась фиксация родового имени по русскому образцу. До этого люди чаще обходились личным именем и отчеством (например, Беркинбай Куанышулы).

Географически фамилия Беркинбаев наиболее плотно представлена в Казахстане (особенно в южных и западных областях), а также среди казахской диаспоры в Узбекистане и Киргизии. В России она редка и встречается в основном у выходцев из Средней Азии. Вариант написания с буквой «ё» (Бёркинбаев) — ошибочный, так как ударение в оригинале падает на последний слог имени (Беркинба́й), и фамилия произносится с ударением на последний слог: Беркинба́ев.

Есть вероятность, что в редких случаях первая часть имени могла быть связана с тюркским глаголом «берк» (беркемек — «укреплять»), что не меняет общего смысла. Сословно предки носителя фамилии — скорее всего, скотоводы-кочевники или земледельцы, так как имя не содержит указаний на знатное происхождение или духовный сан.