Фамилия Беркимбаевы восходит к личному имени Беркимбай — типичному для тюркских народов двусоставному антропониму. Первая часть имени — Берким — скорее всего, связана с древним тюрко-монгольским именем Берке, которое переводится как «сильный, мощный». Вторая часть — «бай» — в тюркских языках означает «богатый хозяин, могущественный человек, господин». Соединяясь, эти компоненты давали имя-пожелание: родители надеялись, что сын вырастет крепким, здоровым и займет высокое положение в обществе.

Фамилия образована по русской модели с суффиксом -ев, который присоединяется к основам, оканчивающимся на согласный или краткий гласный. В казахской и других тюркских средах фамилии на -ев (и -ов) стали массово закрепляться в советское время, поэтому окончательно говорить о точном времени и месте возникновения именно этой фамилии можно лишь на основании серьезных генеалогических изысканий.

Представители рода Беркимбаевых упоминаются в нескольких региональных Памятных книгах Казахстана. В Книге памяти Алма-Атинской области записан Беркимбаев Буркетбек (1890 г. р., Биен-Аксуйский район). В Книге памяти Южно-Казахстанской области — Беркимбаев Джумадулла (1894 г. р., Сузакский район). В Книге памяти Карагандинской области — Беркимбаев Кусаин (1905 г. р., Шетский район). Эти записи показывают географию бытования фамилии: юг и юго-восток современного Казахстана.

Самый известный носитель фамилии — Естай Беркимбаев (1874–1946), казахский советский акын, певец и композитор. Он одним из первых вступил в Союз композиторов Казахстана, получил звание заслуженного деятеля искусств Казахской ССР. Его творческая биография — лучшее свидетельство того, что фамилия, начинавшаяся как личное имя-пожелание, со временем стала родовым знаком, объединившим людей разных поколений и профессий.