Фамилия Берниковия — редкий случай в русской ономастике, и её происхождение неочевидно на первый взгляд. Скорее всего, перед нами не исконно русская фамилия, а позднее искусственное образование или результат адаптации иноязычной фамилии. В русском языке фамилии на -ия почти не встречаются в крестьянской или мещанской среде; они характерны для духовенства (например, Воскресенский, Троицкий, но там окончание -ский) или для полонизированных и литовских родов (-ия как вариант -ий).

Разберем основу. Корень «Берник» может восходить к нескольким источникам. Первый и самый вероятный — от названия ремесла. В немецком языке «Berner» или «Berniker» — это житель Берна или человек, связанный с этим городом, но в русских говорах слово «берник» могло означать кожевника или мастера по выделке берда (деталь ткацкого станка). Второй вариант — отчество от имени Берн, сокращенной формы от Бернард (или Бернгард), которое попало в Россию через немцев-переселенцев или прибалтийских баронов. Третий, более спорный — от слова «берно» (бревно, балка), что дало бы прозвище плотнику.

Суффикс -овия указывает на принадлежность или происхождение, но в русской модели фамилий он нестандартен. Обычно -ович/-овна дают отчества, а -овия — это скорее латинизированная форма, которую могли использовать в канцеляриях XIX века для придания фамилии «благородного» звучания. Поэтому Берниковия могла появиться у выходцев из духовного сословия или у обрусевших немцев, чью фамилию Берников (или Бернике) переделали на польско-латинский манер.

Географически фамилия могла закрепиться на западе Российской империи — в Беларуси, Литве или на Волыни, где смешивались православные, католические и протестантские традиции. В центральных губерниях России Берниковия практически не встречается. Если искать однокоренные фамилии, то Берников, Берниковский, Берник — они куда привычнее, и именно от них, вероятно, и оттолкнулись, добавив окончание -ия для отличия или при регистрации в метрических книгах.

Таким образом, носитель фамилии Берниковия, скорее всего, потомок либо ремесленника-кожевника (или ткача), либо обрусевшего немца, чья фамилия была адаптирована в дворянской или церковной среде. Однозначной версии нет из-за редкости, но ремесленная гипотеза выглядит правдоподобнее: прозвища по занятию давали чаще, чем ссылались на иноземное имя.