Фамилия Берсенеева — женская форма фамилии Берсенев, которая происходит от прозвища или нецерковного имени Берсеня. В основе лежит слово «берсень», которое в древнерусских говорах означало «крыжовник». Это типичный случай, когда прозвище давали по ягоде — либо из-за внешнего сходства (колючий, цепкий человек), либо по месту жительства у зарослей крыжовника. Модель образования проста: к основе на -я добавили суффикс -ев, что характерно для фамилий, образованных от слов с мягким или шипящим окончанием (сравните: Заря — Зарев, Буря — Бурев).

Однако существует и вторая, менее очевидная, но более вероятная для старых родов версия. В документах XVI–XVII веков встречается московский боярский род Берсеневых, и их фамилию связывают не с ягодой, а с тюркским словом «берсен» — «крепкий, сильный, могучий». Это было личное имя или прозвище татарского происхождения, которое носили служилые люди. Известен, например, Иван Берсень-Беклемишев, дьяк при Иване III, казнённый в 1525 году. Его прозвище Берсень как раз могло иметь тюркские корни, а фамилия Берсенев закрепилась за потомками.

Женская форма Берсенеева встречается реже, чем мужская Берсенев, и указывает на принадлежность к роду через отца или мужа. Носительницы этой фамилии — потомки либо русского крестьянина, прозванного за колючий нрав «крыжовником», либо служилого человека с татарскими корнями. Географически фамилия больше распространена в центральных областях России, особенно в бывших московских землях, где жили Берсеневы-дворяне, и в Поволжье, где тюркские имена были обычны. С точки зрения словообразования, суффикс -еев (а не -ев) в женском варианте — это просто грамматическая норма, а не редкая особенность: так склоняются фамилии на -ев в женском роде.