Фамилия Бейсеков образована от казахского имени Бейсек, которое восходит к слову «бесік» («бейсек») - «колыбель». Скорее всего, так называли младшего сына в семье, то есть того, кто долгое время оставался в колыбели. Менее вероятно, что Бейсек — это прозвище, которое мог получить человек, присматривавший за детьми, качавший колыбель. Таким образом, потомок человека, которого звали Бейсек, со временем получил фамилию Бейсеков.