Фамилия Бикинин — редкий пример, где суффикс -ин присоединился к основе, которая сама по себе вызывает споры у этимологов. В отличие от большинства фамилий на -ин, образованных от имён или прозвищ на -а/-я (Иван → Иванов/Иванин), здесь мы имеем дело с прозвищем Бика, которое могло возникнуть как минимум из трёх разных источников.

Самая вероятная версия связывает Бику с украинским словом «бик» — бок. В этом случае прозвище описывало либо внешность (крупный, «широкий в боку» человек), либо место жительства: «биком» называли окраину, то, что находится сбоку, а не в центре. Предок Бикининых мог жить не в самой деревне, а на отшибе. Модель образования проста: прозвище Бика (из «Бик» + окончание -а, характерное для украинских и южнорусских говоров) → фамилия Бикинин (притяжательное прилагательное: «чей?» — Бикинин, то есть сын или потомок Бики).

Менее распространённая, но не менее интересная гипотеза выводит прозвище из болгарского «бик» — бык. Здесь срабатывает древняя славянская традиция охранительных имён: называя ребёнка Бикой, родители символически передавали ему силу, плодородие и власть, которыми издревле наделяли быка. Однако в пользу украинской версии говорит ареал фамилии: Бикинины встречаются в основном в регионах, граничащих с Украиной, где слово «бик» в значении «бок» было в ходу.

Словообразовательный нюанс: фамилия звучит как Бикинин, а не Бикин или Биков. Формант -инин указывает на то, что основа прозвища оканчивалась на -а (Бика), а не на твёрдый согласный. Если бы прозвище было просто Бик, мы бы получили фамилию Биков (по великорусской модели) или Бикин (по украинской, с усечением). Сохранение гласной -и- в суффиксе — косвенный маркер южного или западнорусского происхождения фамилии.