Фамилия Бикунин — редкая и неочевидная с первого взгляда. В ней нет привычного «ремесленного» корня вроде кузнец или плотник, и её основа не сразу поддаётся расшифровке. Разберём словообразовательную модель.

Фамилия образована с помощью патронимического суффикса -ин, который в русской традиции указывал на принадлежность: «чей?» — Бикунин, то есть сын Бикуни. Основа здесь — прозвище или нецерковное имя Бикуня. В русских говорах слово «бикуня» или «бикун» могло иметь несколько значений. Самое вероятное — диалектное «бикун» в значении «забияка, драчун, буян». В этом случае прозвище давали человеку с бойким, неуживчивым характером, любителю пошуметь. Такие прозвища по поведению — один из древнейших пластов русских фамилий, они нередко становились основой для фамилий в крестьянской и посадской среде.

Есть и другая, менее распространённая версия: связь с тюркскими языками. В башкирском и татарском языках существует слово «бик» — «крепкий, прочный» или «господин», а суффикс -ун мог образовывать имя или прозвище. Тогда Бикун — это «крепкий человек» или «господин». Однако эта гипотеза слабее: фамилия Бикунин встречается в основном в русских регионах (особенно в Поволжье и центральной России), а не в тюркоязычных, и её суффикс -ин — типично русский, а не тюркский. Если бы корень был тюркским, фамилия скорее сохранила бы форму без этого суффикса — Бикунов или Бикун.

Примечательно, что фамилия Бикунин не фиксируется в дореволюционных дворянских родословных книгах и не встречается среди известных исторических родов. Это указывает на её происхождение из крестьянской или мещанской среды, где прозвища были особенно живучи. География фамилии сегодня — преимущественно Кировская, Нижегородская области и Удмуртия, что совпадает с зоной распространения севернорусских и волго-вятских говоров, где слово «бикун» в значении «забияка» было в ходу.

Таким образом, носитель фамилии Бикунин, скорее всего, потомок человека по прозвищу Бикуня — драчуна или задиры, получившего это имя не в обиду, а как меткую бытовую характеристику.