Фамилия Бинятова — женская форма, а её основа, мужская фамилия Бинятов, образована по простой и распространённой модели: от личного имени или прозвища с помощью суффикса -ов, который в русском языке указывал на принадлежность («чей?»). В данном случае суффикс присоединён к основе «Бинят». Это сразу подсказывает, что перед нами фамилия, возникшая в среде, где преобладала восточная или тюркская антропонимия, но оформленная уже по русскому патронимическому образцу.

Самая прямая версия — происхождение от тюркского имени Бинят. В ряде тюркских языков (татарском, башкирском, азербайджанском) имя Бинят (или Бинят) восходит к арабскому «биня» — «строение», «здание», но в переносном смысле могло означать «опора», «основа». Имя давали с пожеланием, чтобы ребёнок стал опорой семьи. Встречается и вариант Биннат — с усилением согласного. Таким образом, фамилия Бинятов буквально значит «сын (потомок) Бинята».

Менее вероятна, но возможна связь с диалектным русским словом «биня» — так в некоторых говорах называли бинт или повязку. Тогда прозвище Бинят мог получить человек, носивший повязку, или, в переносном смысле, аккуратный, «перевязанный». Однако эта версия слабее: фамилия почти не встречается в исконно русских регионах и сосредоточена в Поволжье и на Кавказе, что указывает на тюркский след.

Географически фамилия Бинятова (и Бинятов) наиболее характерна для татар, башкир и народов Дагестана. Встречается она и у азербайджанцев. В русском контексте это редкая фамилия, что делает её хорошим маркером этнической истории предков — скорее всего, они были выходцами из тюркоязычной среды, принявшими русскую фамильную форму в ходе межэтнических контактов или при переходе в православие.