Фамилия Бирко — это почти наверняка фонетический вариант фамилии Берко, где «е» перешло в «и» под влиянием акающего произношения или просто со временем. Исходная форма Берко восходит к еврейскому мужскому имени Бер или прозвищу Бер: на идише ber значит «медведь». Так могли назвать человека, который напоминал этого зверя силой, внешностью или повадками. Но возможен и другой путь — фамилию могли дать просто по имени, без всякой связи с характером предка.

Суффикс -ко — характерная черта украинской и белорусской антропонимии. Он указывает, что носитель фамилии или его предок долгое время жил на территории современной Украины или Беларуси. Первоначально фамилия звучала как Берко, а позже, уже в русскоязычной среде, «е» сменилось на «и» — так и появилось Бирко.

Эта версия подтверждается реальными историческими записями. В Книге памяти Мурманской области есть белорусский учитель Бирко Иван Фомич, родившийся в 1899 году в городе Петриков Гомельской области. А в Ленинградском мартирологе значится латыш Бирко Иосиф Никодимович (1904 года рождения), ремонтер фабрики № 1 им. Халтурина. Оба случая показывают, что фамилия бытовала в разных регионах и среди разных народов, но корень у неё общий — тот самый «медвежий» след из идиша.