Фамилия Благодирова образована от прозвища Благодир, которое восходит к украинскому слову «благодійний» — «благотворительный». Скорее всего, такое прозвище закрепилось за человеком, который отличался щедростью и помогал нуждающимся, возможно, жертвовал на общинные нужды или церковь. В украинской ономастике прозвища, начинающиеся на «благо-», нередко давали людям с заметными душевными качествами. Фамилия закрепилась в женской форме через суффикс -ов, который указывает на принадлежность: Благодирова буквально означает «дочь (или жена) Благодира». Такая модель типична для русских и украинских фамилий, где суффикс -ов/-ев присоединялся к основе прозвища или имени. Встречаемость фамилии невысока, что говорит о её локальном бытовании, вероятнее всего, в южнорусских или украинских регионах.