Фамилия Боборикина — женская форма фамилии Боборикин. Её основа — прозвище Боборика, которое восходит к диалектному слову «бобор» или «боборыка». В русских говорах «бобор» означало болтуна, пустомелю или суетливого, беспокойного человека. В некоторых областях так называли того, кто «боборит» — говорит быстро, невнятно, тараторит. Таким образом, прозвище Боборика давали человеку с живым, говорливым характером, возможно, чрезмерно болтливому или суетливому.

Модель образования фамилии — суффикс -ин, который в русских фамилиях указывает на принадлежность: Боборикин — сын Боборики, то есть потомок человека с таким прозвищем. Это характерная черта северных и центральных регионов России, где фамилии на -ин распространены шире, чем на юге. Встречаются и однокоренные фамилии: Боборыкин (та же основа, но с другим суффиксом -ын, что фонетически равно -ин), Бобор, Боборин. Самая известная литературная фамилия этого гнезда — Боборыкин, которую носил писатель Пётр Дмитриевич Боборыкин (XIX век), автор романа «Китай-город». Его предки, вероятно, происходили из тех же мест, где прозвище Боборыка было в ходу.

Стоит отметить, что в основе не лежит слово «бобёр» (животное). От бобра образованы фамилии Бобров, Бобринский, Бобр, а здесь корень другой — «бобор» со значением болтовни и суеты. Версия о связи с бобром маловероятна: суффикс -ык/-ик в русских прозвищах не типичен для названий животных (сравните: бобр — бобрёнок, но не бобрыка). Поэтому этимология через говорливость — основная и наиболее обоснованная.

Фамилия редкая, не входит в сотни самых распространённых. Встречается преимущественно в центральной России и Поволжье, что подтверждает её русское диалектное происхождение. Носительницы фамилии Боборикина могут считать, что их предок был не молчуном, а человеком, который, как говорили в старину, «боборил без умолку» — возможно, он был сказителем, торговцем на ярмарке или просто обладал живым нравом, за что и получил своё прозвище.