Основой фамилии Бобыренко послужило мирское имя Бобырь. Нецерковное имя Бобырь ведет свое начало от диалектного слова «бобырь», которое в воронежских говорах означало рыбку пескаря. Согласно другой версии, в основе фамилии лежит не имя, а прозвище Бобырь, которым нарекли рыбака. Тогда фамилия относится к так называемым «профессиональным» именованиям, указывающим на род деятельности предка. Суффикс -енко, с помощью которого образована эта фамилия, характерен для восточных районов Украины, Белоруссии.