Фамилия Богакова — женская форма фамилии Богаков, а разбирать её стоит с мужского варианта, так как именно от него всё и пошло. В основе лежит прозвище или нецерковное имя Богак. В русской ономастике это довольно редкий случай, когда корень «бог» не связан напрямую с божеством, а, скорее всего, указывает на человека богатого, зажиточного. В диалектах слово «богак» бытовало в значении «богач, состоятельный человек», причем с оттенком не столько хвастовства, сколько уважения к его достатку. Таким образом, первый носитель фамилии, скорее всего, был человеком не бедным, возможно, купцом или зажиточным крестьянином.

С точки зрения словообразования фамилия типична для восточнославянского ареала: суффикс -ов присоединился к основе «Богак», образовав притяжательное прилагательное, которое затем закрепилось как фамилия. Ударение в фамилии, как правило, падает на второй слог: Богако́ва. Интересно, что фамилия могла возникнуть и как «географическая» — если существовало селение с названием Богаково, то выходец оттуда получал прозвище «Богаков», которое потом стало фамилией. Однако такая версия менее вероятна, так как топонимов с таким корнем в русских землях зафиксировано немного.

Фамилия встречается преимущественно в южных и центральных регионах России, а также среди казачества, где прозвища, отражающие социальный статус, были особенно распространены. Известных носителей с такой фамилией в истории немного, что делает её редкой, но оттого не менее интересной для тех, кто хочет проследить свои корни. В некоторых говорах «богака» могли называть не просто богача, а скрягу, который копит добро, — и это добавляет фамилии двойственности, которую стоит учитывать при генеалогическом поиске.