Основой фамилии Богдарин послужило мирское имя Богдари. Дохристианское имя Богдари имеет польское происхождение и переводится как «подарок Бога», «дар Божий». У многих народов многодетная семья традиционно пользуется большим почётом, потому что дети во многих культурах считаются одной из самых главных ценностей. Именем Богдари могли назвать долгожданного ребёнка, возможно, первенца, появление которого стало для семьи большим счастьем, то есть ценным подарком свыше. В ономастике известно несколько имён с таким же значением: греческое Феодор (Теодор), славянское Богдан, еврейское Матвей, тюркско-арабские Аллахбирде, Эгамберди и т. Таким образом, потомок человека, обладающего именем Богдари, со временем получил фамилию Богдарин.