Фамилия Богдарин — прозрачный пример того, как славянское личное имя стало родовым прозванием. В её основе лежит мирское имя Богдари, которое, как и более привычное Богдан, означает «дар Божий» или «подарок Бога». Такие имена давали долгожданным детям, особенно первенцам, чьё появление воспринимали как счастье и милость свыше. В польской традиции, откуда, скорее всего, пришла форма Богдари, это имя тоже было распространено, что неудивительно: у многих народов есть имена с тем же смыслом — греческое Феодор, еврейское Матвей, тюркские Аллахбирде и Эгамберди.

Суффикс -ин в фамилии Богдарин указывает на типичную восточнославянскую модель образования: «чей?» — «сын Богдари». Сначала так говорили о ребёнке, а потом прозвище закрепилось за всем родом. В отличие от фамилий на -ов/-ев, которые чаще встречаются в центральной России, форма на -ин характерна для северных и некоторых южных регионов, а также для фамилий, образованных от имён на -а/-я. Поэтому Богдарины могли появиться в тех местах, где была сильна традиция именно такого суффиксального оформления.

Точное время возникновения фамилии установить трудно: процесс становления фамилий у славян растянулся на несколько столетий, с XV по XVII век. Однако сам факт, что имя Богдари не ушло в забвение, а дало устойчивую фамилию, говорит о том, что носитель этого имени был заметным человеком в своей общине — возможно, уважаемым главой большой семьи.