Фамилия Богодилова — редкий случай, когда в основе лежит не имя, а прямое обращение к Богу. В большинстве фамилий на Бог- (Богданов, Боголюбов) вторая часть — корень от имени или понятия. Здесь же — «дило»: устаревшее диалектное «дело» или, вероятнее, глагол «дити» (деть, делать, класть). Получается «Богодил» — тот, кто «делает Бога» или «кладет Бога». Но это не про творца, а про иконописца.

Самая правдоподобная версия: Богодил — народное прозвище иконописца. В русских говорах «богомаз» — пренебрежительное, а «Богодил» звучало как уважительное: человек, который «творит Бога» (пишет образа). Суффикс -ило в прозвищах обычно обозначал деятеля (ср. «зубрила», «водила»), но с оттенком постоянного занятия. Второй вариант — прозвище богомольца, который «делает Бога» в смысле усердно молится, кладет поклоны, но для такого человека больше подошло бы «Богомол».

Версия с именем Богдан (через форму Богодил) менее убедительна: переход «д» вместо «дн» встречается, но редко, и объяснение теряет прозрачность.

Женский вариант фамилии — Богодилова — указывает, что предок по мужской линии носил фамилию Богодилов. Окончание -ов типично для русских фамилий, образованных от прозвищ на согласный. Встречается фамилия в основном в центральных и южных регионах России, где были развиты иконописные промыслы, в частности в бывшей Владимирской губернии и на Дону. Носителей немного, что подтверждает редкость исходного прозвища — оно не превратилось в массовое, как те же Богдановы.