Фамилия Боклаганич — редкий пример отчества, образованного не от личного имени, а от прозвища Боклаган. Суффикс -ич (в полной форме -анич) прямо указывает на происхождение: «Боклаганич» значит «сын Боклагана». Такая модель типична для южнославянских фамилий (сербских, хорватских), а в русской среде встречается в основном у потомков выходцев с Балкан или в западнорусских землях, бывших под влиянием Речи Посполитой.

Основа прозвища — диалектное слово боклаган, родственное «баклага». Баклагой в старину называли деревянный сосуд с узким горлом, походную флягу для воды или вина. В некоторых говорах так же именовали брюкву — за сходство формы с округлым кувшинчиком. Чередование о/а (боклаган / баклаган) объясняется влиянием «окающих» северных и сибирских говоров, где в безударной позиции произносили «о» вместо литературного «а».

Скорее всего, прозвище дали по занятию. Первый Боклаган мог быть бондарем — мастером, делавшим деревянную посуду, в том числе походные фляги. Менее вероятная, но возможная версия — прозвище закрепилось за огородником, торговавшим брюквой. В любом случае, имя быстро стало наследственным, заменив крестильное имя в быту и документах.

Фамилия Боклаганич почти не встречается в современных списках — это указывает на её локальный характер или угасание рода. Встречаются единичные носители на западе Украины, что подтверждает связь с западными говорами и польско-украинской традицией образования фамилий на -ич.