Фамилия Боклагов происходит от прозвища Боклаг. В его основе лежит диалектное слово «баклага» — старинный узкогорлый деревянный сосуд с крышкой или пробкой, походная фляга. В некоторых говорах так называли и брюкву. Чередование гласных о/а в корне объясняется влиянием «окающих» говоров: на Севере и в Поволжье произносили «боклаг», и это закрепилось в фамилии.

Скорее всего, прозвище Боклаг было профессиональным. Первый носитель мог либо делать деревянную посуду, в том числе баклаги, либо выращивать и продавать брюкву. И то и другое — конкретные занятия, по которым в крестьянской среде давали меткие прозвища. Они легко заменяли имя и передавались детям, превращаясь в фамилию.

Суффикс -ов указывает на типичную русскую патронимическую модель: Боклагов — это «сын Боклага». Таких фамилий, образованных от названий предметов быта, немало: вспомним Ковшов, Ложкин, Горшков. Боклагов стоит в том же ряду, но встречается реже. В словарях русских фамилий эта фамилия не упоминается среди частых, что говорит о её локальном происхождении — возможно, из северных или волжских областей, где слово «баклага» было в ходу.

Иных версий, связывающих фамилию с другими корнями, нет. Значение прозвища прозрачное, а чередование гласных объяснимо диалектной фонетикой, поэтому версия с сосудом или брюквой — основная и наиболее правдоподобная.