Фамилия Болбуков образована от прозвища Болбук. В его основе лежит диалектное слово «болбук» (или «булбук»), которое в ряде русских говоров означало «бугор», «кочка», «шишка», а также «полный, низкорослый человек» или «толстяк». Таким образом, прозвище могло указывать либо на особенности внешности — коренастую, плотную фигуру, либо, в переносном смысле, на характер — возможно, «неповоротливый» или «упрямый, как кочка». В некоторых областях «болбуком» называли и небольшой хлебец, каравай, что тоже могло стать основой для прозвища.

Модель образования типична для русских фамилий: суффикс -ов указывает на принадлежность («чей?»), то есть Болбуков — сын или потомок Болбука. Поскольку прозвище имеет явную диалектную природу, фамилия тяготеет к северным и центральным регионам России, где слово было в ходу. Встречается она нечасто, что подтверждает её локальное происхождение.

Стоит отметить, что фамилия Болбуков нередко попадает в разряд «говорящих» — её основа легко угадывается даже без специальных знаний. В старину прозвище могли дать в насмешку или для краткой характеристики человека, но со временем оно закрепилось как фамильное имя, утратив первоначальный оттенок. В писцовых книгах и ревизских сказках XVII–XVIII веков можно найти единичные упоминания крестьян и посадских людей с такой фамилией, например, в Вологодской и Архангельской губерниях.

В отличие от фамилий на -ин, образованных от основ на -а/-я, Болбуков следует модели отчество от существительного мужского рода с нулевым окончанием. Редкий суффиксальный вариант — Болбукин — встречается исчезающе редко и, скорее всего, вторичен. Таким образом, основная версия остаётся наиболее правдоподобной: фамилия пошла от прозвища, данного по внешнему или бытовому признаку.