Фамилия Большукина — женская форма от Большукин, и её разумнее рассматривать с мужского варианта. В основе лежит не имя и не профессия, а прозвище, образованное от прилагательного «большой». Казалось бы, всё очевидно, но здесь есть тонкость: в русской ономастике фамилии на -укин (-юкин) чаще встречаются в северных и вологодских говорах. Суффикс -ук- (с последующим -ин) указывал на принадлежность: Большук — это «сын Большого» или «человек из семьи Больших». Такая модель типична для регионов, где была распространена украинская или белорусская традиция именования, но в северорусских говорах она тоже прижилась, особенно в формах с «у» вместо «ю».

Прозвище Большой давали не только за высокий рост. В крестьянской среде так могли назвать старшего сына или главу семьи, который вёл общее хозяйство. В документах XVI–XVII веков встречаются записи «Большой» как личное имя или прозвище, а от него уже пошли фамилии Большаков, Большунов и, реже, Большукин. Разница в суффиксах отражает диалектные особенности: -ак-/-як- типично для юга и центра, -ук- — для северо-запада и Поволжья. Таким образом, Большукин — не вариант Большакова, а самостоятельная ветвь, возникшая в местности, где говорили «большук» вместо «большак».

Встречается фамилия и в форме Большукина — она указывает на женщину, но в историческом контексте могла закрепиться за вдовой или дочерью Большукина. Географически фамилия редкая, её можно встретить в Вологодской, Архангельской областях и в Кировской области — то есть там, где сохранились старые говоры с характерным суффиксом. Никакого дворянского происхождения или связи с известными родами у Большукиных нет: это фамилия крестьянская, возникшая в среде, где прозвище точно описывало место человека в семье или общине.