Фамилия Бондура — это скорее всего украинская или белорусская фамилия, которая в своей основе содержит прозвище, данное человеку по профессии или характерной черте. Корень фамилии — «бондур» — является диалектным вариантом слова «бондарь», то есть ремесленник, изготавливающий бочки, кадки и другую деревянную посуду. В украинском и белорусском языках слово «бондар» широко распространено, а форма «бондур» могла возникнуть как местный фонетический вариант или как прозвище, образованное через суффикс -ур(а), который придаёт слову оттенок грубоватости или шутливости.

Модель образования фамилии — прозвище перешло в фамилию без дополнительных суффиксов, что характерно для украинской и польской ономастики. В русской традиции такие фамилии встречаются реже, но на юге России, в регионах, граничащих с Украиной, они не редкость. Если бы фамилия оформилась в русской среде, она бы скорее приобрела суффикс -ов или -ин, став Бондуровым или Бондуриным. Отсутствие суффикса указывает на то, что носитель фамилии, вероятно, происходил из тех мест, где фамилии фиксировались в «голом» виде — на Украине, в Беларуси или в Польше.

Есть и другая, менее вероятная версия: связь с тюркским словом «бондур» (вариант «бундур») — так в некоторых тюркских языках называли вид ткани или одежды. Но для славянской среды такое объяснение маловероятно, так как фамилия не имеет характерных тюркских суффиксов и распространена именно в западнорусских и украинских землях.

Географически фамилия Бондура чаще всего встречается в западных областях Украины, а также в Беларуси и в пограничных с ними российских регионах (Брянская, Смоленская области). В дореволюционных переписях такие фамилии могли фиксироваться у крестьян и мещан — ремесленников, чьё прозвище прямо указывало на занятие. Известных носителей с этой фамилией, оставивших заметный след в истории, нет, но это не умаляет её ценности как маркера профессиональных корней предков.