Фамилия Борисея звучит необычно для русского уха — и это подсказка. Её основа — каноническое имя Борис, а вот суффикс -ея выбивается из привычного ряда. В русской фамильной модели, по наблюдениям Б. Унбегауна, господствуют суффиксы -ов, -ев, -ин, реже -ский или -их. Окончание -ея для русских фамилий нетипично: оно скорее напоминает белорусскую или украинскую традицию, где фамилии на -ея (как Матвея, Демея) встречаются чаще. Поэтому первая и самая вероятная версия: Борисея — это фамилия, записанная в форме родительного или именительного падежа от уменьшительного Борисей (типа Борись). В белорусском языке такая модель продуктивна: от имени Борис могли образовать прозвище Борисей, а затем закрепить его как фамилию без дополнительного суффикса.

Вторая версия, менее распространённая, но имеющая право на существование: фамилия могла возникнуть из западнорусских говоров, где суффикс -ея использовался для обозначения принадлежности или происхождения. Например, «Борисея» могло означать «сын Бориса» или «человек из рода Бориса» — по аналогии с польскими фамилиями на -ея (Борея, Янея). Однако в польском языке такая модель редка, и чаще встречаются формы на -евич.

Третья, самая простая гипотеза: фамилия могла быть искажена при переписи или переселении. Если предок носителя жил на границе русских и белорусских земель (например, в Смоленской, Могилёвской или Витебской губерниях), его фамилию могли записать на слух как Борисея, хотя исходно она звучала как Борисов или Борисевич. Такие «смешанные» формы не редкость в зоне контакта диалектов.

Географически фамилия Борисея сегодня встречается редко — единичные случаи в России, Беларуси и Украине. Это говорит о том, что она не получила широкого распространения, а осталась локальной, возможно, в пределах одного рода. Сословно предки могли быть крестьянами или мещанами: фамилии без типичных дворянских суффиксов (-ский, -ов) чаще всего указывают на непривилегированное происхождение.

Словообразовательный разбор прост: корень Борис- (от древнеболгарского Борис, возможно, тюркского происхождения — «волк» или «богатырь») и окончание -ея, которое, скорее всего, является остатком падежной формы. Если смотреть на фамилию как на прозвище, то Борисея могло означать «маленький Борис» или «Бориска» — ласкательное обращение, которое со временем стало фамилией.