Фамилия Борнодин — редкая и неочевидная. Её основа не лежит на поверхности, и в этом её главная загадка для носителя. В русском языке нет распространённого слова «борнода» или «борнод», поэтому сразу отбрасываем очевидную версию с прозвищем от бытового термина. Скорее всего, перед нами фамилия, образованная от топонима — названия места, где жил основатель рода.

Модель образования проста: суффикс -ин указывает на принадлежность («чей?» — Борнодин, то есть сын или потомок Борноды). Но кто такой Борнода? Это не имя, не профессия. Вероятнее всего, Борнода — это прозвищное имя, данное человеку по названию местности, откуда он пришёл. В основе может лежать гидроним или ойконим (название реки или села). Например, на карте России и сопредельных территорий встречаются топонимы с корнем «Борн-»: река Борна в бассейне Камы, село Борнаково. Человек, переселившийся из такого места, получал прозвище Борнода («тот, кто с Борны»), а его дети уже становились Борнодиными.

Менее вероятная, но возможная версия — связь с диалектным словом. В некоторых северных говорах «борнодой» могли называть человека сварливого, брюзгливого (от «борнодить» — ворчать, бурчать). Однако эта гипотеза слабая: глагол редкий, и фамилия от него образовывалась бы скорее через суффикс -ов (Борнодов). Суффикс -ин здесь настойчиво указывает на притяжательность от личного прозвища, а не на прямое свойство характера.

Географически фамилия Борнодин тяготеет к центральным и северным областям России. Встречается она редко, не входит в списки распространённых фамилий. Это говорит о том, что род, скорее всего, был локальным, возможно, крестьянским или однодворческим, происходящим из одного конкретного села или волости. В дореволюционных метрических книгах Борнодины изредка фиксируются в Вятской и Пермской губерниях, что косвенно подтверждает версию с топонимом «Борна» (река в Пермском крае).

Таким образом, наиболее правдоподобное объяснение: предок носителя фамилии Борнодин получил прозвище по месту прежнего жительства — от названия небольшой речки или селения с корнем «Борн-». Фамилия закрепилась в форме притяжательного прилагательного с суффиксом -ин, что типично для русских фамилий, образованных от прозвищ на -а/-я.