Фамилия Бородавченков — редкий пример того, как простое прозвище обрастало суффиксами, переходя из одной модели именования в другую. В основе лежит слово «бородавка». Прозвище Бородавка давали человеку с заметной родинкой, наростом на коже или, возможно, по сходству с маленьким, цепким человеком (в переносном смысле, как «приставучий»). Такие прозвища по внешним признакам были в ходу на Руси — не обидные, а описательные.

Дальше начинается словообразовательная цепочка. Сначала от прозвища Бородавка образовали фамилию Бородавченков. Суффикс -енк- в этой модели указывает на происхождение: «чей?» — Бородавченков, то есть сын Бородавченка. А Бородавченко — это украинская или южнорусская форма, где суффикс -енко означал «маленький» или «сын» (Бородавченко = сын Бородавки). Когда носитель такой фамилии переселялся в великорусские земли, к ней добавляли типичный русский суффикс -ов, чтобы адаптировать к местной грамматике. Так Бородавченко превратился в Бородавченкова.

Вероятнее всего, предок носителя этой фамилии жил на стыке русских и украинских земель — в нынешних Курской, Белгородской, Воронежской областях или на Слобожанщине. Именно в этих регионах распространены фамилии с двойной фиксацией: сначала уменьшительный суффикс -енко, затем «обрусение» через -ов. В чисто украинской среде фамилия осталась бы Бородавченко, без добавления -ов.

Спорных версий у этой фамилии почти нет. Корень прозрачный, а модель образования типична для восточнославянских фамилий XVII–XVIII веков. Попытки связать её с «бородой» (из-за созвучия) лингвистически несостоятельны: суффикс -авк- указывает на конкретный мелкий предмет, а не на часть лица. Так что Бородавченков — это буквально «внук того, кого звали Бородавкой», и фамилия эта — живой след миграции людей с Украины в центральную Россию.