Фамилия Бородаев образована от прозвища Бородай, которое в старину давали человеку с заметной, окладистой бородой. В основе лежит древнерусское слово «борода», а суффикс -ай указывал на обладателя яркого признака — так же появились Губай (от «губа»), Усай, Носаев. Потомок человека по прозвищу Бородай со временем получил фамилию Бородаев по стандартной для XVI–XVII веков модели: к основе на -ай прибавляли патронимический суффикс -ев (как в фамилиях Губаев, Каратаев). Интересно, что в южнорусских говорах слово «бородай» могло означать не только бородача, но и опытного, взрослого мужчину — главу рода, поэтому прозвище могло нести оттенок уважения. В документах XVII века встречаются крестьяне и посадские люди с этой фамилией в Курской и Воронежской губерниях, что подтверждает её связь с чернозёмной полосой России.