Фамилия Бойкабилов — редкий пример, где славянская словообразовательная модель наложилась на тюркское имя. Основа здесь — мужское имя Бойкабил, которое состоит из двух частей: «бой» (в тюркских языках — «богатый», «господин», «вождь») и «кабил» (арабское слово, заимствованное через ислам, означающее «способный», «сведущий», «принимающий»). В целом имя Бойкабил можно перевести как «богатый знаниями» или «способный господин». Суффикс -ов указывает на принадлежность: Бойкабилов — «сын (или потомок) Бойкабила».

Географически фамилия тяготеет к регионам, где веками жили тюркские народы, принявшие ислам, — прежде всего к Средней Азии (Узбекистан, Таджикистан, юг Казахстана) и к некоторым районам Северного Кавказа. В русских архивных записях XIX — начала XX века такую фамилию могли фиксировать у выходцев из Бухарского эмирата или Хивинского ханства, которые переселялись в южные губернии Российской империи. Встречаются варианты написания Бойкабилов и Байкабилов — чередование «ой/ай» характерно для разных диалектов тюркских языков (ср. «бай» и «бой»).

Интересная деталь: в отличие от большинства русских фамилий на -ов, где основа обычно славянская (Иванов, Кузнецов), здесь мы видим полный перенос восточного имени в русскую паспортную форму. Это говорит о том, что предок-носитель имени Бойкабил (или его сын) получил фамилию в момент массовой паспортизации, проводившейся в Российской империи и СССР, когда чиновники часто записывали отчество отца как фамилию. Социальный статус предка, судя по значению имени, мог быть выше среднего — купец, мулла, зажиточный земледелец или местный старшина. Ремесленная версия (от названия профессии) здесь маловероятна, так как «бойкабил» не фиксируется как прозвище по занятию.

Однокоренных фамилий в русском ономастиконе мало. Можно вспомнить фамилию Бойкабанов (где вторая часть — «хан»), но она встречается ещё реже. Основная масса носителей Бойкабиловых сосредоточена сегодня в Узбекистане и Таджикистане, в России эта фамилия единична.