Фамилия Бойкинич имеет украино-белорусское происхождение (на что указывает суффикс -ич) и образована от слова «бойкий», которое легло в основу прозвища Бойко — так называли расторопного, ловкого и находчивого человека. Возможно,оно указывало на род занятий предка: Бойником в архангельских говорах называли забойщика, бьющего рыбу острогой. Таким образом, потомок человека, обладающего прозвищем Бойко, со временем получил фамилию Бойкинич.