Фамилия Брагонин — редкий случай, когда прозвище, скорее всего, связано не с характером или внешностью, а с конкретным занятием, причем не самым престижным. В основе фамилии лежит слово «брага» — слабоалкогольный напиток, домашнее пиво. В словаре Даля «брага» также имеет переносное значение: «пьянство», «гульба». Соответственно, Брагоней в народе могли прозвать либо того, кто варил брагу на продажу (браговара, пивовара), либо человека, который, мягко говоря, не прочь был эту брагу выпить, то есть горького пьяницу.

Суффикс «-ин» указывает на типичную русскую модель образования: от основы на -а/-я. Брагоня — так могли называть человека в быту, а его дети становились Брагониными. В говорах встречаются варианты «брагоня» в значении «пьяница», что делает вторую версию вполне жизнеспособной. Обратите внимание: фамилия образована не напрямую от «брага», а от уменьшительно-пренебрежительной формы — «Брагоня». Это важная деталь, которая отличает Брагониных от, скажем, Брагиных или Браговых.

В официальных документах фамилия встречается крайне редко. Если верить разрозненным данным, основная масса носителей исторически сосредоточена в центральных и северных губерниях России — в Ярославской, Костромской, Вологодской областях. Там варение браги было традиционным домашним промыслом. Встречаются Брагонины и среди старообрядцев, которые в XIX веке часто держались за старые, «говорящие» прозвища.

Споров у этимологов эта фамилия не вызывает: корень прозрачен, суффикс типичен. Единственный нюанс — не стоит путать Брагонина с фамилией Барагонин (от «барагон» — балаган, шалаш) или с польско-белорусскими фамилиями на «-оня» (например, Брагонь). В русском контексте значение однозначно упирается в брагу. Так что предки современного Брагонина — либо мастеровые люди, варившие хмельное питье на всю округу, либо те, кого в деревне знали как любителя выпить, но вряд ли осуждали за это слишком строго.