Фамилия Брандышев — редкий случай, когда прозвище, скорее всего, образовано от глагола со значением «ворчать» или «роптать». Основа «бранд-» восходит к диалектному глаголу «брандышить», который в ряде говоров (особенно тверских и псковских) означал «ворчать, брюзжать, браниться». Человек, получивший такое прозвище, вероятно, был недовольным, придирчивым или просто любил поворчать. Это не столько ругательство, сколько бытовая характеристика — в деревнях такие прозвища давали без злого умысла, для точности.

Суффикс «-ышев» в этой фамилии заслуживает отдельного внимания. В русской ономастике модель на «-ыш» (как в фамилиях Малышев, Голышев, Кудряшев) образует прозвища от прилагательных, указывая на яркий признак: «малыш» — маленький, «голыш» — бедный или лысый. Но здесь основа — глагольная, а не адъективная. «Брандыш» — это не «обладающий свойством», а «тот, кто делает». Это более редкий словообразовательный ход: от глагольной основы через суффикс «-ыш» образовывали имя деятеля. Фамилия Брандышев, таким образом, стоит в одном ряду с такими же редкими вариантами, как, скажем, Долбышев (от «долбить») или Тормошев (от «тормошить»).

Географически фамилия привязана к северо-западу России. По данным современных исследований и архивных записей, основное ядро носителей Брандышевых исторически сосредоточено в Тверской и Псковской губерниях. Там же фиксировались и однокоренные фамилии — Брандышев, Брандышевский, а также просторечная форма Брандыш. Это подтверждает и словарь русских фамилий: корень «бранд-» в значении «ворчать» — явление именно северо-западных говоров, а не общелитературное.

Встречается также версия, что фамилия могла произойти от личного имени Брандыш — уменьшительной формы от крестильного имени Абрам (в просторечии — Бранко, Брандыш). Однако эта гипотеза слабее: во-первых, форма «Брандыш» для Абрама нехарактерна и не зафиксирована в святцах, во-вторых, глагольное происхождение объясняет фамилию проще и без натяжек. Правдоподобнее считать, что перед нами прозвище по характеру, а не переделанное календарное имя.

О дворянском происхождении Брандышевых данных нет. Фамилия не входит в списки столбового дворянства, а её носители в XIX веке числились в основном среди крестьян и мещан. Это не умаляет её ценности: такие фамилии — прямая речь предков, их живая характеристика, застывшая в паспорте. Брандышев — это «сын ворчуна», и в этом слышен не упрёк, а память о конкретном человеке, которого в деревне знали по его привычке брюзжать на погоду, на начальство или на соседей.