Фамилия Братченкова — женская форма от Братченков, а та, в свою очередь, восходит к прозвищу или имени Братченко. Это типичная восточнославянская модель с уменьшительно-ласкательным суффиксом -енк(о), который в украинской и южнорусской традиции часто означал «сын» или «младший родственник» того, кто назван в корне. В основе лежит слово «брат». Если перед нами не имя при крещении (а братом в народе называли любого близкого, почти родного человека), то исходное прозвище Братченко мог получить младший брат, сын брата или просто человек, которого в общине считали «своим», как брата.

В отличие от фамилий вроде Братов или Братцев, которые образованы через притяжательные суффиксы (-ов, -ев), форма на -енко указывает на более личное, даже ласкательное отношение. Братченко — это не просто «братов», а «маленький брат», «братишка». Фамилия Братченков, таким образом, означает «потомок Братченко». Суффикс -ов в мужской форме Братченков — уже великорусский, он прикрепился к украинской основе, когда носитель переселился в северные или центральные области России, где фамилии на -ов были нормой.

Географически фамилия чаще встречается в Курской, Белгородской, Воронежской областях — на стыке великорусских и малорусских земель, где такие гибридные формы как раз и возникали. В старых писцовых книгах XVII века можно найти упоминания служилых людей и крестьян с прозвищем Братченко, но конкретных известных носителей, оставивших яркий след в истории, среди Братченковых нет — фамилия оставалась в основном крестьянской и мещанской. Единственная особенность, которую стоит заметить: ударение в фамилии плавающее. В разных семьях говорят и Братченков, и Братченков, и даже Братченков. Первый вариант (на первый слог) ближе к древнему прозвищу, второй (на второй) — к современной литературной норме.