Фамилия Братченя — характерный пример восточнославянской модели фамилий, где суффикс -еня указывает на уменьшительно-ласкательную или «сыновью» форму. В польской и белорусской традиции этот суффикс часто присоединяли к основе, чтобы обозначить младшего родственника или потомка: Братченя — буквально «маленький брат» или «сын брата». Поэтому фамилия не столько прозвище, сколько указание на родственную связь.

Основа Брат- восходит к общеславянскому bratъ — «брат». В украинском и белорусском языках слово «брат» имело и более широкий смысл: им называли не только кровного родственника, но и двоюродного, сводного брата, а также близкого друга, побратима. Прозвище Братченя могло закрепиться за человеком, который приходился кому-то младшим братом или племянником, но не исключён и переносный смысл — так могли назвать доброго, отзывчивого товарища, «своего в доску».

С точки зрения словообразования, фамилия Братченя стоит в одном ряду с такими белорусскими и украинскими фамилиями, как Иванченя, Степанченя, Гриценя. Все они образованы по одной схеме: личное имя или прозвище + суффикс -еня, который со временем застыл в качестве фамильного показателя. В русской традиции этот суффикс встречается реже, поэтому фамилия имеет чёткую западнорусскую, белорусскую или украинскую привязку.

Географически фамилия Братченя чаще всего встречается в Беларуси (особенно в Гродненской и Брестской областях) и на северо-западе Украины. В России она редка и обычно указывает на корни предков из этих регионов. По данным современных телефонных справочников, носители фамилии компактно проживают также в Литве и Польше — в зонах исторического расселения белорусов.

Сословной принадлежности у фамилии нет: её могли носить и крестьяне, и мещане, и казаки. В ревизских сказках XIX века Братченя встречается среди свободных сельских обывателей Минской и Волынской губерний. Никакой связи с религиозным саном или монашеством у этой фамилии не прослеживается — версия о «религиозных взглядах» основателя выглядит натянутой. Куда правдоподобнее, что прозвище просто указывало на родство или дружеские качества человека.