Фамилия Братышева образована от прозвища Братыш. В его основе лежит диалектное слово «братище» — так в старину называли не только родного, но и двоюродного или сводного брата, а также просто друга и товарища. Такие «братские» прозвища были широко распространены: они закрепляли родственные или близкие отношения между людьми. Скорее всего, Братышем называли доброго, отзывчивого человека или верного друга.

Есть и другая версия: слово «брат» могло означать члена религиозного братства или монаха. В этом случае прозвище Братыш указывало на религиозные взгляды или род деятельности предка. Обе гипотезы правдоподобны, но первая встречается чаще — прозвища по родству и характеру давали повсеместно, тогда как монашеские прозвища были более локальны.

Сама фамилия Братышева образована по стандартной модели: к основе Братыш добавился суффикс -ев (вариант -ов после мягкого согласного). Суффикс указывает на принадлежность: «Братышева» значит «дочь или жена Братыша». В мужском варианте фамилия звучит как Братышев.

Фамилия редкая, её география неширокая. Встречается в основном в центральных и северных регионах России, где диалектное слово «братище» было в ходу. Сословных ограничений у неё не было: прозвище Братыш могли дать и крестьянину, и горожанину, и монаху.