Фамилия Бруня — это, скорее всего, не крестильное имя, а прозвище. В её основе лежит древний глагол «брунеть», значение которого неоднозначно и зависит от контекста. Первый и самый яркий смысл — «звенеть, звучать, жужжать, гудеть или бренчать». Соответственно, Бруней могли прозвать человека с громким, зычным голосом. Но та же характеристика могла относиться и к музыканту-любителю: балалаечнику, гусляру или тому, кто постоянно что-то наигрывал.

Однако у глагола «брунеть» есть и другие, совершенно противоположные значения — «зреть, спеть, наливаться» (о плодах) и «седеть, белеть». Вторая версия происхождения фамилии отталкивается от этих смыслов. В таком случае прозвище Бруня мог получить либо садовод, чьи яблоки или вишни хорошо «брунели» (наливались соком и поспевали), либо пожилой человек, чьи волосы начали «брунеть» (седеть, выцветать). Оба варианта правдоподобны, но первый («звенящий» или «играющий») встречается в ономастике чаще: прозвища по поведению и характеру давали охотнее, чем по возрасту.

Сама фамилия образовалась без суффикса, напрямую от прозвища. Форма Бруня — это краткое, обиходное именование, которое затем закрепилось за потомками без изменений (как, например, Сова или Шило). Такая модель (фамилия, совпадающая с прозвищем) характерна для украинских, белорусских и южнорусских земель. Географически фамилия Бруня редкая и тяготеет к западным и юго-западным регионам бывшей Российской империи. Встретить её можно в старых записях Черниговской, Киевской и Могилёвской губерний.

Однокоренные фамилии — Брунов, Брунцев, Брунёв — образуют более стандартные варианты с суффиксами принадлежности. Но сама фамилия Бруня сохранила архаичную, беспадежную форму, что делает её особенно ценной для историка языка: она донесла до нас живое прозвище в его первоначальном виде, без позднейшей «русификации» через суффиксы.