Фамилия Брусенина образована от прозвища Брусенина, а оно, скорее всего, связано с брусникой. В старину «брусенина» или «брусница» — это не только ягода, но и растение, и даже место, где она растет, брусничник. Прозвище мог получить человек, живший неподалеку от брусничного бора, либо тот, кто промышлял сбором и продажей ягод. В северных и сибирских говорах слово «брусенина» иногда означало и сам ягодный напиток, так что прозвище могло закрепиться за любителем или изготовителем брусничного морса.

Фамильный суффикс -ин указывает на принадлежность: Брусенина — дочь или жена Брусени, то есть человека с таким прозвищем. В отличие от фамилий на -ов/-ев, которые чаще встречаются у потомков по мужской линии от имен на твердый согласный, -ин типичен для основ, оканчивающихся на -а/-я. Это одна из самых распространенных моделей в русской ономастике, но здесь она держится на редкой основе: брусенина — слово не частое в бытовом обиходе.

Интересно, что фамилия Брусенина почти не встречается в центральных и южных областях России. Ее география тяготеет к северу и северо-востоку: Архангельская, Вологодская, Кировская области, а также Урал. Это совпадает с ареалом распространения брусники — ягоды, которая в тех краях была не просто лакомством, а важным подспорьем в хозяйстве. В более южных регионах, где брусника не растет, фамилия либо исчезает, либо получает другое объяснение.

Версия о связи с брусникой — основная и наиболее правдоподобная. Альтернативные гипотезы, например, от слова «брус» (бревно) или от диалектного «брусенить» (точить, отбивать косу), менее убедительны: форма «брусенина» от «брус» дала бы скорее фамилию Брусов или Брусилов, а глагольная основа обычно образует прозвища вроде Брусило. Так что, скорее всего, предок носителя этой фамилии имел прямое отношение к ягоде — либо собирал ее, либо торговал, либо жил в брусничных местах.