Скорее всего, фамилия Бугера — это украинский вариант еврейско-немецкой фамилии Бугер (Бухер). Она происходит от аналогичного прозвища, которое образовано от немецкого слова Buche - «бук» при помощи суффикса -er. Возможно, Бухером называли человека, рядом с домом которого росло большое дерево бука. Также не исключено, что основатель рода Бугера жил в буковом лесу. По другой версии, в основе этой фамилии лежит слово bukh, что в переводе с идиша означает «книга». Суффикс -ер нередко используется при образовании «профессиональных» прозвища, поэтому возможно, что основатель рода Бугера был книготорговцем. Позднее к фамилии Бугер был добавлен украинский суффикс -а. Например, только у евреев можно было встретить такие фамилии, как Вейценбаум, что в переводе с немецкого означало «пшеничное дерево», Зауэрштром – «кислый поток», Левенфиш – «рыба-лев», Цигенбаум – «козье дерево», Квечман – «высказываться неохотно».