Фамилия Бугина — одна из тех, что хранят в себе не столько личную характеристику человека, сколько описание места, где он жил. В её основе лежит прозвище Буга, а оно восходит к слову «буга» — так в южных и центральных говорах называли низменные берега рек, которые весной заливаются водой. Владимир Даль уточняет: на этой полосе вода «перебуравливает лес», образует овраги, наклоняет кусты по течению. Это не просто сырое место, а целый ландшафт: ивняк, осокорник, пойменный лес, где река каждый год перекраивает русло.

Человек, получивший прозвище Буга, скорее всего, жил на такой пойме или владел там угодьями. В отличие от многих фамилий, образованных от внешности или характера, эта отсылает к конкретному географическому объекту. Суффикс -ин стандартно указывает на принадлежность: «чей?» — Бугин, то есть сын или потомок Буги. Модель типична для русских фамилий, но основа здесь редкая — слово «буга» малоупотребительно за пределами диалектов.

Поскольку прозвище не было связано с социальным статусом или ремеслом, носители фамилии Бугины могли происходить из самых разных сословий — от крестьян до однодворцев. В документах фамилия встречается в основном в южнорусских регионах, особенно в Тамбовской, Воронежской и Рязанской губерниях, где пойменные ландшафты были обычны. Встречается и вариант Бугин (мужская форма), а Бугина — это либо женская линия, либо форма в родительном падеже, закрепившаяся как фамилия.

Других версий происхождения, например от тюркских корней или от глагола «бугать» (кричать), всерьёз рассматривать не стоит: они не подтверждаются ни словарями, ни географией бытования. Фамилия Бугина — редкий случай, когда прозвище не описывает человека, а буквально называет его по месту жительства: тот, кто с буги, с пойменного берега.