Фамилия Буканаева — женская форма от Буканаев, и её разбор стоит начать с самого неочевидного: суффикса. В русских фамилиях на -аев обычно скрывается тюркская основа, и здесь тот же случай. Суффикс -аев (а не -ев) указывает на то, что корень оканчивался на твёрдый согласный или гласный, а само слово пришло из языков, где «б» и «п» могли чередоваться. Основа «Букан» — это личное имя или прозвище, распространённое у тюркских народов. В башкирском, татарском или казахском языках слово «букан» (или «пүкән») означает «пень», «колода», «чурбан». Прозвище могли дать коренастому, крепкому человеку или, напротив, медлительному и неповоротливому — в зависимости от контекста. Реже «букан» связывают с названием растения или с диалектным глаголом со значением «бухнуть», «упасть».

Фамилия Буканаев — типичный пример ассимиляции тюркского имени в русской среде. Её носители, скорее всего, происходят из регионов, где русские и тюркские народы жили рядом: Поволжье, Урал, Оренбуржье. В этих краях в XVI–XIX веках шёл активный обмен прозвищами и именами, и многие фамилии на -аев закрепились за крестьянами, казаками или мещанами. Сословная принадлежность не восстанавливается однозначно, но можно предположить, что предки Буканаева не принадлежали к высшей знати — такие фамилии чаще встречались у служилых людей «по прибору» или у государственных крестьян.

Интересная деталь: в некоторых говорах русского севера слово «букан» означало «домовой» или «дух», но эта версия менее вероятна для фамилии, так как ареал бытования фамилии — юго-восток. Если сравнивать с однокоренными, то фамилия Буканов встречается чаще, а Буканаев — более редкий вариант, где суффикс -аев сохранил прямой след тюркского произношения. В итоге версия с прозвищем от «пня» остаётся основной: она проста, логична и подтверждается типовыми моделями образования фамилий в регионе.