Фамилия Бухари — одна из тех, что сразу выдают географическое происхождение своего носителя. Её основа — топоним Бухара, название древнего города в Средней Азии (ныне Узбекистан). В русской традиции фамилии такого типа обычно оформлялись суффиксом -ов/-ев или -ин, но здесь мы видим редкий случай: фамилия сохранила восточную форму без добавления русского патронимического суффикса. Это указывает на то, что предок носителя, скорее всего, был выходцем из Бухары или имел с этим городом прочную связь — торговую, культурную или религиозную.

В Российской империи фамилия Бухари бытовала в нескольких социальных средах. Во-первых, среди купцов и ремесленников, которые вели дела с Бухарским эмиратом. Во-вторых, среди татарских и башкирских семей: в Поволжье и Приуралье «бухарцами» называли купцов, привозивших среднеазиатские товары, а также мусульманских учёных и проповедников, приезжавших из Бухары — крупного центра исламского образования. Поэтому носитель фамилии мог быть потомком либо зажиточного торговца, либо муллы или учителя медресе.

Словообразовательная модель проста: основа Бухар- (от названия города) плюс окончание -и. В тюркских языках такой формант часто указывает на принадлежность к месту или роду. В русском контексте фамилия осталась «необрусевшей» — её не переделали в Бухаров или Бухарин, что говорит о достаточно позднем закреплении (вероятно, в XIX веке) или о сохранении самоназвания семьи. Интересно, что однокоренная фамилия Бухарин, напротив, образована по стандартной русской модели с суффиксом -ин, и её носители могли быть из тех же краёв, но уже ассимилированные.

Встречается фамилия и в других странах бывшего СССР, особенно в Татарстане, Башкортостане, а также в Средней Азии, где её этимология очевидна. В России она редка, но не уникальна: её можно найти в старых метрических книгах Оренбургской и Казанской губерний, где жили татары и башкиры. Таким образом, фамилия Бухари — не прозвище по характеру или внешности, а чёткий географический маркер, указывающий на связь предка с одним из величайших городов Шёлкового пути.