Фамилия Бухонин — один из тех случаев, когда за простой на вид основой скрывается сразу несколько возможных историй. Словообразовательная модель здесь прозрачна: суффикс -ин указывает на принадлежность («чей?»), то есть Бухонин — это «сын Бухони» или потомок человека, которого в округе знали под прозвищем Бухоня. Такая модель типична для русских фамилий, образованных от прозвищ или мирских имён, оканчивающихся на -а/-я.

Что же могло означать само прозвище? Самая прямая версия — диалектное слово бухоня, которым в некоторых русских говорах называли толстяка, пузатого человека. Прозвище давали по заметной внешней особенности, без обидного оттенка, а скорее как бытовую характеристику. В этом случае родоначальник Бухониных был человеком плотного телосложения.

Вторая версия уводит в другую сторону — к украинскому глаголу «бухати». У него два значения: издавать глухие, низкие звуки (бухать, ухать) и — более экспрессивное — бить, стрелять, колотить. Если прозвище Бухоня возникло на южнорусских или малороссийских территориях, оно могло указывать на род занятий. Бухоней могли прозвать воина, который «бухает» из ружья или пушки, либо силача, работающего с шумом и размахом. Третья возможность — особенность речи: человек говорил глухо, «бухающе», словно издалека.

Обе версии имеют право на существование, и выбрать единственную без знания конкретной семейной истории невозможно. География бытования фамилии могла бы подсказать: в северных и центральных губерниях вероятнее связь с «толстяком», в южных и украинских — с «буханием». Но в любом случае, Бухонин — фамилия, образованная от прозвища, которое давали по живому, заметному качеству: внешности, характеру или занятию.