Фамилия Бухонин образована от личного прозвища и относится к распространенному типу русских фамилий. Фамилия Бухонин образована от прозвища Бухоня. Бухоней в России называли толстяка, пузатого человека. Согласно другой версии, прозвище Бухоня восходит к украинскому глаголу «бухати», который переводится на русский как «произносить глухие звуки», а также «бить, стрелять». В этом случае прозвище Бухоня содержало указание либо на род занятий человека (он мог быть воином), либо на особенности его речи. Таким образом, потомок человека, обладающего прозвищем Бухоня, со временем получил фамилию Бухонин. О точном месте и времени возникновения фамилии Бухонин в настоящее время говорить сложно, поскольку процесс формирования фамилий был достаточно длительным. Тем не менее, фамилия Бухонин представляет собой замечательный памятник славянской письменности и культуры.