Фамилия Бухонов — наглядный пример того, как прозвище, связанное с хлебом насущным, закрепилось в родовом имени. В основе лежит слово «бухон» — так в древнерусском языке называли вид хлеба, каравай или ковригу. Об этом, в частности, пишет этимолог Макс Фасмер, возводя слово к древнерусскому «бухонъ». Поэтому первая и самая прямая версия: прозвище Бухон дали пекарю или торговцу хлебом. Такие «профессиональные» прозвища были распространены на Руси: они точно указывали, чем человек зарабатывает на жизнь, и со временем переходили в фамилии без дополнительных суффиксов.

Менее очевидная, но тоже возможная версия тянется к украинскому глаголу «бухати». У него два значения: издавать глухой звук или бить, стрелять. Если следовать этой логике, Бухоном могли прозвать человека с громким, низким голосом либо воина — стрелка или того, кто бил в барабан. Однако эта гипотеза слабее: хлебная основа встречается чаще и имеет прямое соответствие в древнерусских памятниках.

Суффикс -ов в фамилии указывает на принадлежность: Бухонов — это «сын Бухона» или «из рода Бухона». Такой способ образования типичен для русских фамилий, сложившихся в XV–XVII веках у крестьян и посадских людей. Сословных перегородок фамилия не знала: пекарь мог быть и крепостным, и ремесленником в городе.

Однокоренных фамилий немного, но они есть: Буханов, Бухонин. Бухонов отличается от них именно основой: если Буханов мог произойти от «буханка» (той же булки), то Бухонов сохранил более архаичную форму «бухон». Встречается фамилия в основном в центральных и южнорусских областях — там, где пекли именно бухоны, а не, скажем, калачи.