Скорее всего, фамилия Бухонов образована от прозвища Бухон, которое восходит к слову «бухон». Фасмера, оно произошло от древнерусского «бухонъ» - «вид хлеба». Исходя из этого, можно предположить, что прозвище Бухон относилось к числу «профессиональных» именований, содержавших указание на род занятий человека. Так, Бухоном могли называть пекаря. Согласно другой версии, прозвище Бухон восходит к украинскому глаголу «бухати», который переводится на русский как «произносить глухие звуки», а также «бить, стрелять». В этом случае основатель рода Бухоновых мог быть воином или человеком с громким голосом. Так и прозвище Бухон закрепилось за человеком в качестве наиболее употребительного именования, а со временем легло в основу фамилии Бухонов. Таким образом, потомок человека, обладающего прозвищем Бухон, со временем получил фамилию Бухонов.