Фамилия Бундя — редкая и короткая, но её происхождение не так просто, как кажется на первый взгляд. В русской ономастике фамилии на -я обычно указывают на украинское, белорусское или южнорусское происхождение, а также часто являются прозвищными по своей природе.

Скорее всего, в основе фамилии лежит прозвище Бундя. В южных и западных говорах слово «бундеть» означало «ворчать», «брюзжать», «роптать» или «говорить невнятно, бормотать». Человека с таким характером — вечно недовольного или неразборчиво говорящего — и могли прозвать Бундей. Суффикс -я в прозвищах часто придавал оттенок ласкательности или, наоборот, иронии, как в словах «тихоня», «грязнуля», «рохля». Фамилия Бундя могла закрепиться за потомками такого ворчуна.

Есть и другая, менее очевидная версия. В некоторых диалектах «бунда» означала «толстяк», «неповоротливый человек». Это тоже возможный источник прозвища, но первая версия — с глаголом «бундеть» — встречается в ономастической литературе чаще и выглядит убедительнее.

Географически фамилия Бундя встречается в основном на западе России, в Беларуси и на Украине. В русском языке она не получила типичного патронимического суффикса -ов или -ин, что как раз характерно для украинской и белорусской традиции, где фамилии нередко оставались в чистой форме прозвища.

Стоит упомянуть и редкую возможность связи с польским словом «będzie» (будет) — но это скорее народная этимология, не подтверждённая данными. Фамилия Бундя — это, в первую очередь, живое прозвище, отражающее характер или манеру поведения предка.