Фамилия Бунегин образована от прозвища Бунега. Вполне возможно оно происходит от старинного слова «буня» - так в старину называли спесивого, гордого человека. Поэтому прозвище могло быть связано с характером родоначальника. Существует и другая версия, согласно которой в основе этого прозвища лежит диалектный глагол «бунить» - «гудеть, мычать, реветь». В этом случае прозвище Бунега могли дать человеку с невнятной речью. Таким образом, потомок человека, обладающего прозвищем Бунега, со временем получил фамилию Бунегин.