Фамилия Бурнатский — редкий случай, когда географическая привязка перевешивает прозвищную или профессиональную версию. В отличие от множества фамилий на -ский, которые в XVIII–XIX веках массово давали семинаристам от названий церковных праздников или латинских корней, Бурнатский почти наверняка ведёт начало от топонима. На карте Восточной Европы есть несколько мест с корнем «бурнат»: село Бурнаты в современной Львовской области Украины, хутор Бурнаты в Беларуси, а также ряд урочищ в Подолье и на Волыни. Человек, переселившийся из такой местности, получал прозвание Бурнатский — «тот, кто из Бурнат».

Словообразовательная модель прозрачна: суффикс -ский (-цкий) в польской и западнорусской традиции указывал на принадлежность к месту или владельцу. В Речи Посполитой, откуда идёт большинство фамилий этого типа, окончание -ский было маркером шляхетского происхождения, но на практике его быстро переняли и крестьяне, и мещане. Так что Бурнатский мог быть как мелким земянином, владевшим хутором Бурнаты, так и простым крестьянином, записанным при переписи по месту жительства.

Сам корень «бурнат» — тёмный. Есть две правдоподобные версии. Первая: от румынского или молдавского «burnat» — «закопчённый, дымный», что могло относиться к чёрной, выжженной земле или к избе, где топили по-чёрному. Вторая: от тюркского «burun» — «нос, мыс», то есть «Бурнаты» могло означать «место на мысу» или «носовая возвышенность». Обе версии рабочие, но первая вероятнее для Подолья и Буковины, где славянские говоры активно контактировали с романскими.

Фамилия Бурнатский остаётся локальной и немногочисленной. Её носители встречаются в основном на западе Украины, в Беларуси и среди потомков переселенцев в Сибири и на Дальнем Востоке. В дореволюционных метриках она могла писаться через «о» — Борнатский, что связано с аканьем или описками писаря. Семинарская версия (от латинского «burnus» — «смуглый») маловероятна: для духовного сословия типичны фамилии вроде Преображенский или Рождественский, а Бурнатский слишком привязан к конкретной местности, чтобы быть искусственным.