Фамилия Бусаков образована от прозвища или нецерковного имени Бусак. В основе лежит слово «бус» — в южнорусских и украинских говорах так называли мелкий дождь, туман, пыльцу, а в некоторых диалектах — сорную траву. Следовательно, Бусаком могли прозвать либо человека, родившегося в пасмурную погоду, либо того, кто был суетливым и неосновательным (как «бус» — нечто мелкое, летучее), либо крестьянина, занимавшегося прополкой или жившего в местности, заросшей бусиной (вид кустарника). Суффикс -ак типичен для прозвищ, характеризующих внешность или поведение (ср. Гусак, Дубак).

Менее вероятна, но возможна связь с тюркским «бус» — «пар, туман», что указывало бы на смуглый цвет лица или задумчивый нрав. Однако славянская версия надёжнее, поскольку фамилия распространена в центральных и южных областях России, а также на Украине, где диалектное слово «бус» хорошо известно.

Фамилия Бусаков — одна из типичных «патронимических» фамилий на -ов, то есть означала «сын Бусака». Встречаются и однокоренные фамилии: Бус, Бусин, Бусов, Буслаев, Бусыгин. Интересно, что в старых писцовых книгах XV–XVII веков фиксируется имя Бусак: например, в Новгородских землях упоминается крестьянин Бусак Ондреев (около 1495 года). Это подтверждает, что прозвище бытовало задолго до закрепления фамилий.

Среди носителей фамилии Бусаков известны люди разных сословий: от крестьян до купцов и священников, но массового дворянского рода не сложилось. В XX веке фамилия встречалась в Воронежской, Ростовской, Волгоградской областях, что совпадает с ареалом диалектного слова «бус». Сегодня она остаётся редкой, но не исчезнувшей — её можно найти в реестрах жителей юга России и среди потомков переселенцев в Сибирь.