Фамилия Бутукина — женская форма фамилии Бутукин, и её разбор стоит начать с неочевидного на первый взгляд суффикса. В ней нет привычного -ов или -ев, зато есть -ин, который в русских фамилиях указывает на принадлежность: «чей?» — «Бутукин», то есть сын или потомок человека по прозвищу или имени Бутука. Именно эта модель — основа на -а или -я плюс суффикс -ин — характерна для северных и центральных областей России, где фамилии образовывали от прозвищ, а не от крестильных имён.

Корень «бутук» или «бутука» — слово неоднозначное. В русских говорах «бутуз» означает крепыша, толстяка, а «бутукать» — бормотать, говорить невнятно. Скорее всего, прозвище Бутука дали либо плотному, коренастому человеку, либо тому, кто говорил неразборчиво, «бутукал». Есть и версия, что основа тюркская: в ряде тюркских языков «бутук» — это «ветка» или «сук», но для русской фамилии такое значение маловероятно — прозвища по частям дерева давали редко, и обычно они превращались в фамилии через суффикс -ов (Бутуков). Суффикс -ин указывает на славянский, а не тюркский путь образования.

Географически фамилия Бутукин (и Бутукина) тяготеет к северо-востоку: её фиксируют в старых переписях Вологодской, Архангельской и Вятской губерний. В этих краях суффикс -ин был особенно распространён, и прозвища на -а встречались чаще, чем в южных областях. Если предки носительницы фамилии происходят оттуда, то, вероятно, они были крестьянами или посадскими людьми — в дворянской среде фамилии на -ин от прозвищ редки.

Сравнение с однокоренными фамилиями помогает уточнить картину. Бутузов — самая частая родственная фамилия, её основа «бутуз» понятна и сегодня. Бутукин — более редкий вариант, где прозвище звучало как Бутука, а не Бутуз. Возможно, это диалектная форма того же корня: в некоторых говорах «бутуз» превращался в «бутука» через смягчение конечного согласного. Таким образом, Бутукина — фамилия, которая хранит звучание местного говора и указывает на предка с заметной внешностью или манерой речи.