Фамилия Буйдова — женская форма от Буйдов, и её разумнее всего разбирать с мужского варианта, чтобы добраться до корня. Модель типичная: основа Буйд- плюс патронимический суффикс -ов, указывающий на принадлежность («чей?» — сын Будда). Но что за слово Буйд? Тут возможны два пути, и один ведёт к довольно редкому пласту лексики.

Самая прямая версия — отчество от прозвища Буйдо. В русских говорах слово «буйда» или «буйдо» фиксируется в значениях «шумный, крикливый человек», «задира», «беспокойный». В. И. Даль в своём словаре приводит «буйда» как синоним «буяна» и «крикуна». Прозвище давали человеку с крутым нравом, который не давал спуску соседям. Суффикс -о в прозвищах (ср. Гуляй — Гуляйдо, Бур — Бурдо) характерен для северных и сибирских говоров, так что географически фамилия Буйдов скорее всего возникла на Русском Севере или в Поволжье, где такие словоформы были в ходу.

Вторая версия, менее очевидная, но не менее интересная — связь с диалектным «буйдо» в значении «небольшой холм, бугор» или «возвышенное место». В некоторых говорах «буй» означает «открытое возвышенное место», а «буйда» — производное. Тогда прозвище могло достаться человеку, жившему на пригорке, или же быть топонимическим — от названия деревни Буйдово. Такие деревни действительно встречаются, например, в бывшей Костромской губернии. Выбрать между двумя версиями сложно, но первая (прозвище по характеру) встречается в ономастике чаще: фамилии от «буй-» корня (Буйнов, Буянов) массово образованы от буйного нрава, а не от рельефа.

Фамилия Буйдова — не массовая, редкая. Встречается в центральных областях России и на Урале, что подтверждает её северное или волжское происхождение. В списках дворянских родов она не значится, так что предки носителя фамилии, скорее всего, были крестьянами или посадскими людьми, получившими фамилию по уличному прозвищу родоначальника. В написании путаницы нет: только через «у», вариант «Бойдова» был бы от другого корня.