Фамилия Буймистру — редкий случай, когда славянская основа и румынский суффикс слились в одной словоформе. Если отбросить окончание -у, которое в молдавских и румынских фамилиях часто указывает на родительный падеж (принадлежность), остаётся основа «Буймистр». Первая часть — «буй» — в восточнославянских говорах означала «глупый», «безумный», «отчаянный», «буйный». Вторая часть — «мистр» — искажённое «мастер» (от лат. magister через посредство немецкого Meister или польского majster). Таким образом, прозвище Буймистр могло относиться к человеку, которого считали «безумным мастером» — либо из-за его дерзкого, непредсказуемого нрава, либо из-за необычного, рискованного подхода к ремеслу.

Географически фамилия почти наверняка родом из Молдовы или украинского Приднестровья, где веками пересекались восточнославянские и романские языковые стихии. В этих краях суффикс -у (Буймистру) — стандартный показатель принадлежности: «сын Буймистра» или «из рода Буймистров». В русском языке та же модель дала бы фамилию Буймистров, но в молдавской среде закрепилась форма без суффикса -ов.

Словообразовательная модель необычна: прозвище сложено из двух корней, причём второй — заимствованный из германских языков. Это говорит о том, что носитель прозвища, вероятно, был ремесленником, но его мастерство оценивали неоднозначно — отсюда и «буй» в начале. Альтернативная, менее правдоподобная версия связывает первую часть с тюркским «буй» (рост, стан), но тогда смысл «высокий мастер» звучит натянуто и не объясняет пренебрежительного оттенка, который обычно несут славянские прозвища с корнем «буй-».

В документах фамилия встречается редко, преимущественно в записях XIX–XX веков из Бессарабской губернии и современной Молдовы. Сословная принадлежность, скорее всего, мещанская или крестьянская — сложные прозвища-композиты редко давали дворянам, у которых преобладали фамилии на -ский/-цкий или от имени родоначальника.