Фамилия Черноухов — не самая частая, но при этом прозрачная по смыслу и любопытная по словообразованию. Если разобрать её по частям, сразу видно: в основе лежит прозвище, которое дали человеку по внешнему признаку. «Черноух» — тот, у кого чёрное ухо. Такие прозвища на Руси давали без злого умысла, просто как меткую примету: рыжий — Рыжов, лысый — Лысов, кривой — Кривов. Черноухов, соответственно, потомок человека по прозвищу Черноух.

Интересна тут модель образования. Большинство русских фамилий на -ов образованы от основ, оканчивающихся на твёрдый согласный: Кузнец — Кузнецов, Сокол — Соколов. Но здесь основа «Черноух» заканчивается на задненёбный «х». В древнерусском языке после «х» в родительном падеже было окончание -а: «сын Черноуха», откуда и пошла фамилия Черноухов. Это не редкий, но характерный случай, который отличает фамилию от, скажем, гипотетического «Черноушев» (если бы прозвище звучало как «Черноуш»).

Прозвище Черноух могло относиться и к животным: так иногда называли чёрных собак или котов с приметным окрасом. Но в качестве человеческого прозвища оно работало так же — закреплялось за человеком с тёмным ухом, возможно, родимым пятном или просто за тем, кто часто ходил чумазым. В некоторых говорах «черноухим» могли назвать и человека с тёмными, почти чёрными волосами, если они особенно бросались в глаза.

Географически фамилия тяготеет к северным и уральским областям. Встречается у староверов, в документах Пермской и Вятской губерний XIX века. Это не дворянская фамилия, а крестьянская или мещанская, что типично для прозвищного происхождения. Суффикс -ов указывает на то, что фамилия оформилась уже после XV века, когда на смену отчествам на -ич пришли семейные именования на -ов/-ев.

Если сравнивать с однокоренными — Черноухов стоит в ряду с Белоуховым, Красноуховым, Синеуховым. Все они редки, но показательны: такие фамилии почти не выходят за пределы восточнославянского ареала и хорошо сохраняют живую народную речь. Никакой тайны в фамилии нет — это просто меткое прозвище, которое стало родовым именем.